• 1) Colección de la Sección de Patología (Colección original del Museo);

• 2) Colección de la Fiebre Amarilla (una de las preocupaciones de Oswaldo Cruz cuando fue nombrado Director General de Salud y por el que delegó el depósito en la colección del material de autopsia de los casos de epidemia de principios del siglo pasado), y

• 3) Colección del Departamento de Patología del IOC (Colección de investigación que se originó y que todavía recibe material para su colección proveniente de encuestas que fueron / son realizadas por el Departamento de Patología, cuyo origen es la Sección / División de Patología).

Por lo tanto, estamos rescatando la filosofía de Oswaldo Cruz al restructurar el Museo como una manera de componer el Patrimonio Histórico y Científico del COI y de la Ciencia nacional en su ámbito de aplicación.